1.根系颜色分析：根的长度、面积、体积、根尖计数、根系存活数量等研究。

2.根系连接分析：用于根系分支角度、连通性等形态研究。

3.根系拓扑分析：连接数量、路径长度等研究。

4.根系分级伸展分析：记录根系整体等级分布情况。

5.扫描仪面板下方和上盖中设计双光源照明系统，并预留双光源校准区域。

6.配备不同尺寸专用高透明度根系放置盘。

7.匀光设计，保证获取图像质量。

8.分析软件采用非统计学方法测量计算出交叉重叠部分根系长度、直径、面积、体积、根尖等基本的形态学参数。